Hi,<br><br>We have been running the Ensembl genebuild pipeline using v58 code. GeneBuilder fails at TranslationAdaptor->fetch_by_Transcript with the message "Could not find start or end exon in transcript_id=1386". I think the reason is the module fails while trying to match start/end exons in the output db GENEBUILD_DB when it should be the source db UTR_DB. <br>
<br>I have checked v59 code and there have been many changes (Transcript, TranscriptAdaptor, TranslationAdaptor), so perhaps one of these already addresses this problem. However I'm not sure which module I should download. <br>
<br>Can the Ensembl team please provide some tips?<br><br>Thank you.<br><br>Alison<br>