
<html>

<head>

<style><!--

.hmmessage P

{

margin:0px;

padding:0px

}

body.hmmessage

{

font-size: 10pt;

font-family:微软雅黑

}

--></style>

</head>

<body class='hmmessage'>

HI all,<div><br></div><div>I have try to index uniprot-sprot database on my system.</div><div><br></div><div>however, i failed to 'indicate' program belonging to 'ensc-core' package, the following is the inputs and outputs:</div><div><br></div><div><div>jiangwenkai@node69:~/uniprot> /home/SCE/jiangwenkai/ensembl/ensc-core/src/Programs/indicate -d $PWD -f uniprot_sprot.fa -i /home/SCE/jiangwenkai/uniprot_index/</div><div>Program for generating OBDA indices</div><div>Steve M.J. Searle.  searle@sanger.ac.uk  Last update Feb 2004.</div><div>Using File:  [uniprot_sprot.fa]</div><div>      Index: [/home/SCE/jiangwenkai/uniprot_index/]</div><div>Primary parser = </div><div>Error: Didn't find func named </div><div>Got function address 0</div><div>Size of /home/SCE/jiangwenkai/uniprot/uniprot_sprot.fa = 178258503</div><div>Match for uniprot_sprot.fa is /home/SCE/jiangwenkai/uniprot/uniprot_sprot.fa</div><div>Segmentation fault (core dumped)</div></div><div><br></div><div>my system is a SUSE linux cluster, the file system is NFS disk array, the memory of the head node is 16GB.</div><div><br></div><div>Any suggestions?</div><div><br></div><div>wenkai</div>                                       </body>

</html>