Perhaps use pan compara and not division specific DBs:<div><br></div><div><div>mysql> use ensembl_compara_pan_homology_6_59</div><div>Database changed</div><div>mysql> select * from ncbi_taxa_name where name like 'Aspergillus nidulans' \G</div>

<div>*************************** 1. row ***************************</div><div>  taxon_id: 162425</div><div>      name: Aspergillus nidulans</div><div>name_class: genbank anamorph</div><div>1 row in set (0.30 sec)</div><div>

<br></div><div>mysql> use ensembl_compara_fungi_6_59</div><div>Database changed</div><div>mysql> select * from ncbi_taxa_node;</div><div>Empty set (0.04 sec)</div><div><br></div><div>dan.</div><div><br></div>Daniel S. T. Hughes M.Biochem (Hons; Oxford), Ph.D (Cambridge)<br>

-------------------------------------------------------------------------------------<br><a href="mailto:dsth@cantab.net">dsth@cantab.net</a><br><a href="mailto:dsth@cpan.org">dsth@cpan.org</a><br>
<br><br><div class="gmail_quote">2010/9/25 Daniel Hughes <span dir="ltr"><<a href="mailto:dsth@ebi.ac.uk">dsth@ebi.ac.uk</a>></span><br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">

<div><div></div><div class="h5"><span style="font-family:arial, sans-serif;font-size:12.5px;border-collapse:collapse"><div>Not very familiar with Compara, but perhaps:</div>
<div><br></div><div><div>mysql> use aspergillus_nidulans_core_6_59_6e</div><div>Database changed</div><div>mysql> select meta_value from meta where meta_key = 'species.taxonomy_id' \G</div><div>*************************** 1. row ***************************</div>


<div>meta_value: 162425</div><div>1 row in set (0.09 sec)</div><div><br></div><div>mysql> use ensembl_compara_metazoa_6_59</div><div>Database changed</div><div>mysql> select * from ncbi_taxa_name where name like 'Aspergillus nidulans' \G</div>


<div>*************************** 1. row ***************************</div><div>  taxon_id: 162425</div><div>      name: Aspergillus nidulans</div><div>name_class: genbank anamorph</div><div>1 row in set (0.10 sec)</div><div>


<br></div><div>mysql> use ensembl_compara_fungi_6_59</div><div>Database changed</div><div>mysql> select * from ncbi_taxa_name where name like 'Aspergillus nidulans' \G</div><div>Empty set (0.12 sec)</div><div>


<br></div></div><div>Dan</div><div><br></div></span>Daniel S. T. Hughes M.Biochem (Hons; Oxford), Ph.D (Cambridge)<br>-------------------------------------------------------------------------------------<br><a href="mailto:dsth@cantab.net" target="_blank">dsth@cantab.net</a><br>


<a href="mailto:dsth@cpan.org" target="_blank">dsth@cpan.org</a><br>
<br>
</div></div></blockquote></div><br></div>