
<html>

<head>

<style><!--

.hmmessage P

{

margin:0px;

padding:0px

}

body.hmmessage

{

font-size: 10pt;

font-family:微软雅黑

}

--></style>

</head>

<body class='hmmessage'>

<meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=utf-8"><span class="Apple-style-span" style="font-family: Verdana, Simsun, Tahoma, Arial, sans-serif; line-height: 15px; font-size: 12px; color: rgb(42, 42, 42); ">Hi all,<div style="line-height: 15px; "><br style="line-height: 15px; "></div><div style="line-height: 15px; ">when i try to run exonerate using test_runableDB, one error occurs:</div><div style="line-height: 15px; "><div style="line-height: 15px; "><br></div></div><div style="line-height: 15px; "><div style="line-height: 15px; ">Can't call method "isa" on unblessed reference at /home/SCE/jiangwenkai/ensembl/ensembl-pipeline/scripts/test_RunnableDB line 168.</div></div><div style="line-height: 15px; "><br style="line-height: 15px; "></div><div style="line-height: 15px; ">The error was caused by the following code in test_runnableDB script.</div><div style="line-height: 15px; "><br style="line-height: 15px; "></div><div style="line-height: 15px; "><div style="line-height: 15px; ">  foreach my $out (@output) {</div><div style="line-height: 15px; ">    if ($out->isa("Bio::EnsEMBL::Gene")) { This line is where the error message come from</div></div></span>                                    </body>

</html>