<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
  <head>

    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=ISO-8859-1">
  </head>
  <body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
    Hi<br>
    <br>
    Is there any way to get all of the watson snps using the perl api.
    The  var_class property of a variation feature only applies to the
    dnsnp classification of a variation (e.g. snp, indel etc)<br>
    <br>
    To get watson snps from dbsnp you have to use the limits<br>
    <p class="MsoNormal"><span style="font-family: Helvetica;"
        lang="EN-US">Using the
        option: </span></p>
    <p class="MsoNormal"><span style="font-family: Helvetica;"
        lang="EN-US">Individual
        SNP: Watson </span></p>
    <p class="MsoNormal"><span style="font-family: Helvetica;"
        lang="EN-US">SNP Class:
        SNP<br>
      </span></p>
    <p class="MsoNormal"><span style="font-family: Helvetica;"
        lang="EN-US">Is there an equivalent to this in the perl api?<br>
      </span></p>
    <p class="MsoNormal"><span style="font-family: Helvetica;"
        lang="EN-US">thanks<br>
      </span></p>
    <br>
  </body>
</html>