<font class="Apple-style-span" face="georgia, serif">Hi,</font><div><font class="Apple-style-span" face="georgia, serif"><br></font></div><div><font class="Apple-style-span" face="georgia, serif">I have setup the local BlastViewe. The output I am getting is not inline with the output on <a href="http://www.ensembl.org">www.ensembl.org</a>.</font></div>
<div><font class="Apple-style-span" face="georgia, serif">I suspect it is due to improper setting of certain <span class="Apple-style-span" style="font-size: 12px; ">attributes in the general section</span> in Defaults.ini (/SERVER_ROOT/conf/ini-files).</font></div>
<div><font class="Apple-style-span" face="georgia, serif">Can you please elaborate more on what exactly needs to be set for the following attributes.</font></div><div><font class="Apple-style-span" face="georgia, serif"><div>
ENSEMBL_REPEATMASKER          </div><div>ENSEMBL_BLAST_FILTER          </div><div>ENSEMBL_BLAST_MATRIX </div></font></div><div><font class="Apple-style-span" face="georgia, serif">ENSEMBL_CALC_GENOTYPES_FILE</font></div><div>
<font class="Apple-style-span" face="georgia, serif"><br></font></div><div><font class="Apple-style-span" face="georgia, serif"><br></font></div><div><font class="Apple-style-span" face="georgia, serif"> is output different because of not setting these parameters?</font></div>
<div><font class="Apple-style-span" face="georgia, serif"><br clear="all"><br>-- <br>ANKIT AGRAWAL</font><br>
</div>