Dear all,<br><br>I need to create a list that is similar to part of the  UCSC RefLink table:<br><br><div>+-----------------+--------------------------+</div><div>| Field           | Type                  |</div><div>+-----------------+--------------------------+</div>

<div>| name          | varchar(255)       |</div><div>| product       | varchar(255)       |</div><div>| mrnaAcc     | varchar(255)       |</div><div>| protAcc       | varchar(255)       |</div><div>| geneName   | int(10) unsigned  | </div>

<div>| prodName    | int(10) unsigned  |</div><div>| locusLinkId  | int(10) unsigned  |   </div><div>| omimId        | int(10) unsigned  | </div><div>+------------------+-------------------------+</div><div><br></div><div>

I only need the refseq IDs, mrnaAcc (e.g. NM_001086914) and protAcc (e.g. NP_001080383). Ideally I'd like to do it by using the Ensembl Perl API. </div><div>So far I am able to get all transcripts, but got stuck in figuring out a way to map RefSeq onto ENST IDs.</div>

<div><br></div><div>Any suggestions welcome!</div><div><br></div><div>Many thanks,</div><div>Thomas</div>