Hello<div><br></div><div>I apologize if this is a newbie question but I have been working on a script that calculates the consequences of a variation on each possible transcript within a gene.</div><div>It works fine and I am able to get all possible consequences. Nevertheless I am finding it hard to to find a way to calculate the new protein sequence that results form say a non-synonymous coding variation.</div>

<div>I am able to retrieve the translation of the transcript I am interested in but I did not find a way to get the resulting protein sequence from the variation I am interested in.</div><div><br></div><div>Would anybody be able to point me in the right direction?</div>

<div><br></div><div>Thank you for your help</div><div><br></div><div>Best regards</div><div><br></div><div>   Duarte Molha</div><div><br clear="all">=========================<br>     Duarte Miguel Paulo Molha<br>  Email: <a href="mailto:duartemolha@gmail.com">duartemolha@gmail.com</a><br>

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