
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">

<HTML><HEAD>

<META http-equiv=Content-Type content=text/html;charset=gb2312>

<META content="MSHTML 6.00.6000.17063" name=GENERATOR></HEAD>

<BODY id=MailContainerBody 

style="PADDING-RIGHT: 10px; PADDING-LEFT: 10px; PADDING-TOP: 15px" leftMargin=0 

topMargin=0 CanvasTabStop="true" name="Compose message area">

<DIV><FONT face=Arial>Hi all,</FONT></DIV>

<DIV><FONT face=Arial></FONT> </DIV>

<DIV><FONT face=Arial>I found some cases of get_all_Exons() get nothing for some 

transcripts. It will cause throw out in 

/Bio/EnsEMBL/DBSQL/TranslationAdaptor.pm:147.</FONT></DIV>

<DIV><FONT face=Arial>Does any one know the possible reasons for fails in 

this function? The genes were created by genebuilder. There may have 

some unfinished jobs or rerun jobs. I have check the 

gene/transcript/exon/translation table. Exons were exists in the table, but I 

get nothing when using the function get_all_Exons(). For most of genes 

and transcripts it works fine.</FONT></DIV>

<DIV><FONT face=Arial>Thanks!</FONT></DIV>

<DIV><FONT face=Arial></FONT> </DIV>

<DIV><FONT face=Arial>Jinfeng</FONT> </DIV></BODY></HTML>