<div class="gmail_quote">On Thu, Jun 2, 2011 at 12:42 AM, William Spooner <span dir="ltr"><<a href="mailto:whs@eaglegenomics.com">whs@eaglegenomics.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
So you should already be able to use the Ensembl API as you suggest. They are in the 'otherfeatures' database, so you need to specify this DB when getting adaptors from the registry in your script. For example;</blockquote>
</div><br><div>Indeed! Thanks so much for your time, Will.</div><div><br></div><div>I'm comparing exon structures now as I did previously and am seeing much higher concordance. I'll followup with details when I've got all of the data.</div>
<div><br></div><div>-Reece</div><div><br></div><div><br></div>