Hello. I am trying to identify duplications that have occured within a group of species. I have gone through the tutorial and the mailing list archives and couldn't find anything on it. I will use the example on the webpage that explains the homology definitions (<a href="http://ensembl.genomics.org.cn:8058/info/docs/compara/homology_method.html" target="_blank">http://ensembl.genomics.org.cn:8058/info/docs/compara/homology_method.html</a>) to illustrate what I am trying to do. Using just human and mouse, as on the diagram, I would like to query with Hsap1 and get the set of (Hsap1, Mmus1); query with Hsap2 and get (Hsap2, Hsap2', Mmus2, Mmus2'); and query with Hsap3 and get (Hsap3, Mmus3, Mmus3'). Is there a way to specify the homology type and, more importantly, restrict the species to be considered for definining the homology? <br clear="all">


<br>Thanks for any help,<br>Jason Merkin<br><br>