Dear Henrikki,<div><br></div><div>Centromeres are amongst the hardest part of a genome to sequence and assemble as they tend to be highly repetitive. I do not have personal knowledge of the availability of centromeres in the vertebrate assemblies but my expectation is that they will be poorly represented. Someone from the genebuild team or helpdesk may be able to provide more information.</div>
<div><br></div><div>regards</div><div>Dan<br><br><div class="gmail_quote">On 14 February 2012 10:18, Henrikki Almusa <span dir="ltr"><<a href="mailto:henrikki.almusa@helsinki.fi">henrikki.almusa@helsinki.fi</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi all,<br>
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I would like to retrieve centromere areas for ensembl genomes, but can't seem to find anything how they are marked in database. I will use perl api to retrieve them from local copy. How are these marked in the database?<br>

<br>
Regards,<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
-- <br>
Henrikki Almusa<br>
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