Dear Sergei,<div><br></div><div>The other drosopholids are part of Ensembl Genomes and you can use the same scripts/mart queries to get UTRs or flanking sequences from them. </div><div><br></div><div>See <a href="http://metazoa.ensembl.org">metazoa.ensembl.org</a>.</div>
<div><br></div><div>regards</div><div>Dan<br><br><div class="gmail_quote">On 16 February 2012 19:53, Sergei Manakov <span dir="ltr"><<a href="mailto:manakov@ebi.ac.uk">manakov@ebi.ac.uk</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Hello,<br>
<br>
I Drosophila melanogaster is in the core Ensembl, so it is<br>
straightforward to get it's UTRs (both positions, sequences and gene<br>
names).<br>
<br>
But what about other Drosophilas (I am interested in D. virilis): they<br>
are not in the core Ensembl, maybe they are in compara? If so, does<br>
somebody perhaps already have a script that fetches UTRs of other<br>
Drosophilas? This would be very much appreciated!<br>
<br>
thanks,<br>
Sergei<br>
<br>
_______________________________________________<br>
Dev mailing list    <a href="mailto:Dev@ensembl.org">Dev@ensembl.org</a><br>
List admin (including subscribe/unsubscribe): <a href="http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev" target="_blank">http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev</a><br>
Ensembl Blog: <a href="http://www.ensembl.info/" target="_blank">http://www.ensembl.info/</a><br>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br>Ensembl Genomes | VectorBase | i5K insect genome initiative<br>
</div>