<html dir="ltr">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" id="owaParaStyle"></style>
</head>
<body fpstyle="1" ocsi="0">
<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;">
<div>Hi,</div>
<div><br>
</div>
<div>I have accessed the Ensembl Species Tree generated for use in Phylowidget<font face="Luxi Sans,Helvetica,Arial,Geneva,sans-serif"> by the Compara team </font>(<font face="Luxi Sans,Helvetica,Arial,Geneva,sans-serif">which includes all the current species
 for the main Ensembl website, plus a few additional mammalian species of interest).</font></div>
<div>
<div class="BodyFragment"><font size="2">
<div class="PlainText"><span class="Apple-style-span" style="font-size: 13px; ">
<div><font face="Luxi Sans,Helvetica,Arial,Geneva,sans-serif"><br>
</font></div>
<div><font face="Luxi Sans,Helvetica,Arial,Geneva,sans-serif">However, I cant find out what the branch lengths represent (number of substitutions per site? PAM units?) and how they were calculated? </font></div>
<div><font face="Segoe UI,Helvetica,Arial,sans-serif"><br>
</font></div>
<div><font face="Segoe UI,Helvetica,Arial,sans-serif">Thanks very much for any help.</font></div>
<div><font face="Segoe UI,Helvetica,Arial,sans-serif"><br>
</font></div>
<div><font face="Segoe UI,Helvetica,Arial,sans-serif">Alison Wright</font></div>
</span></div>
</font></div>
</div>
</div>
</body>
</html>