
<html>

<head>

<style><!--

.hmmessage P

{

margin:0px;

padding:0px

}

body.hmmessage

{

font-size: 10pt;

font-family:微软雅黑

}

--></style></head>

<body class='hmmessage'><div dir='ltr'>

Hi.<br><div><div dir="ltr"><br>I'm trying to analyze the data generated by Affymetrix Mouse Gene 1.0 ST<br>expression arrays. I tried to use Ensembl API to map their probe. However, I need to <br>define the parameter fetch_by_name_vendor or fetch_by_name_class. I don't know the name API stores for the above platform.<br><br>My perl script is attached below.<br>=================================<br>use Bio::EnsEMBL::Registry;<br>use Bio::EnsEMBL::Funcgen::Array;<br>my $registry = 'Bio::EnsEMBL::Registry';<br>$registry->load_registry_from_db(<br>      -host       =>'ensembldb.ensembl.org',<br>      -user       =>'anonymous',<br>      -species    =>'mus musculus',<br>      -db_version =>'65',<br>);<br>my $aa=$registry->get_adaptor('mus musculus','funcgen','array');<br>my $array=$aa->fetch_by_name_vendor('???', 'AFFY');<br>my @probesets = @{$array->get_all_ProbeSets()};<br>==================================<br>??? denotes the platform name I need to input. How could I get it?<br><br>Wish your help! Thanks very much!<br><br>Best, Mei <br><br>                                       </div></div>                                        </div></body>

</html>