<span style>Dear all,</span><div style><br></div><div style>I used the DumpFakeMultiAlign.pl to try to fetch EPO MSA.</div><div style>My first question is </div><div style>How to set the registry_conf? or Can I set species in command without aliases?</div>

<div style><br></div><div style>I use "Bio::EnsEMBL::Registry->load_registry_from_url" to set my registry_conf.</div><div style>Then run command </div><div style>perl DumpFakeMultiAlign.pl --species human --seq_region 3 --seq_region_start 15112000 --seq_region_end 15113000 --alignment_type EPO --set_of_species human:chimp:gorilla:orangutan:macaque:marmoset:mouse:rat:cow:pig:cat:horse</div>

<div style><br></div><div style>but encounter an error</div><div style><br></div><div style><div>------------------ DEPRECATED ---------------------</div><div>Deprecated method call in file DumpFakeMultiAlign.pl line 275.</div>

<div>Method Bio::EnsEMBL::DBSQL::MetaContainer::get_Species is deprecated.</div><div>Call is deprecated. Use $self->get_common_name() / $self->get_classification() / $self->get_scientific_name() instead</div><div>

Ensembl API version = 67</div><div>---------------------------------------------------</div><div><br></div><div>-------------------- EXCEPTION --------------------</div><div>MSG: No matches found for name 'Homininae Homo sapiens' and assembly '--undef--'</div>

<div>STACK Bio::EnsEMBL::Compara::DBSQL::GenomeDBAdaptor::fetch_by_name_assembly /usr/src/ensembl-compara/modules//Bio/EnsEMBL/Compara/DBSQL/GenomeDBAdaptor.pm:131</div><div>STACK toplevel DumpFakeMultiAlign.pl:278</div>
<div>
Ensembl API version = 67</div><div>---------------------------------------------------</div></div><div style><br></div><div style>I tried to read manuals and Q&A, but it is not easy to understand for me so far.</div>
<div style>
Please give me some hints or solution.</div><div style><br></div><div style>Sincerely,</div><div style><br></div><div style>Fenix</div>