<div>A dump for the ncRNA trees is produced in different formats, one of them is newick:</div><div><br></div><div><a href="ftp://ftp.ensembl.org/pub/current_emf/ensembl-compara/homologies/Compara.67.ncrna.nh.emf.gz">ftp://ftp.ensembl.org/pub/current_emf/ensembl-compara/homologies/Compara.67.ncrna.nh.emf.gz</a></div>
<div><br></div><div>A.</div><br><div class="gmail_quote">On Mon, Jul 2, 2012 at 9:20 AM, Marc P. Hoeppner <span dir="ltr"><<a href="mailto:mphoeppner@gmail.com" target="_blank">mphoeppner@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi,<br>
<br>
google wasn't being helpful with this particular problem, so I'll try it here:<br>
<br>
I am looking for a short script (or some helpful explanation) that allows me to produce a newick-formatted gene tree for a non-coding RNA. The only examples I was able to find seem to be based on a much earlier version of the API and I had no luck getting it to work.<br>

<br>
Any help would be greatly appreciated!<br>
<br>
/Marc<br>
<br>
______________________________<u></u>_________________<br>
Dev mailing list    <a href="mailto:Dev@ensembl.org" target="_blank">Dev@ensembl.org</a><br>
List admin (including subscribe/unsubscribe): <a href="http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev" target="_blank">http://lists.ensembl.org/<u></u>mailman/listinfo/dev</a><br>
Ensembl Blog: <a href="http://www.ensembl.info/" target="_blank">http://www.ensembl.info/</a><br>
</blockquote></div><br>