Hi All<div><br></div><div>I use AIP to retrieve gene information. When retrieve species aspergillus_fumigatus, an error occurs.</div><div>My DB version is 67 and 14_67, API version is 67.</div><div><br></div><div><br></div>
<div><div>-------------------- WARNING ----------------------</div><div>MSG: Aspergillus_fumigatus is not a valid species name (check DB and API version)</div><div>FILE: Bio/EnsEMBL/Registry.pm LINE: 1172</div><div>CALLED BY: Bio/EnsEMBL/Registry.pm  LINE: 957</div>
<div>Ensembl API version = 67</div><div>---------------------------------------------------</div><div><br></div><div>-------------------- EXCEPTION --------------------</div><div>MSG: Can not find internal name for species 'Aspergillus_fumigatus'</div>
<div>STACK Bio::EnsEMBL::Registry::get_adaptor /usr/local/Ensembl/src/ensembl/modules/Bio/EnsEMBL/Registry.pm:959</div><div>STACK toplevel /usr/local/Ensembl/perl/EnsemblDataNew.cgi:83</div><div>Ensembl API version = 67</div>
<div>---------------------------------------------------</div></div><div><br></div><div>The line 83 of my script is:</div><div> my $gene_adaptor = $registry->get_adaptor($my_specise, 'Core', 'gene' );</div>
<div><br></div><div>I doubt it's API problem. Can you check it ?</div><div><br></div><div>Thanks million<br clear="all"><div><br></div>-- <br><div><font face="verdana, sans-serif" size="1">Gang Chen</font></div><div><font face="verdana, sans-serif" size="1">TILSI</font></div>
<div><font face="verdana, sans-serif" size="1"><span style="background-color:rgb(255,255,255)">Taicang Institute For Life Science Information</span><br style="background-color:rgb(255,255,255)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)">Address: A2/162, Renmin South Road, Taicang, 215400, Jiangsu Province, P.R.China</span><br style="background-color:rgb(255,255,255)">
<span style="background-color:rgb(255,255,255)">Phone:£¨+86£©512-82782588</span></font></div><br>
</div>