Dear developer, <div><br></div><div>I am using API version 67 and my aim is to retrieve feature sets for 3 specific cell types (IMR90, MRC5, TIG3). I try to do so by fetching the cell type by name and then fetching the feature set by CellType. The script works fine for the IMR90 cell type, however when I try to get the cell type object for MRC5 or TIG3 I get an error for uninitialized value</div>
<div><br></div><div><div><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">  </span>my $ct_adaptor= $registry->get_adaptor('Human', 'funcgen', 'celltype');</div><div><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">   </span>my $ctype_1= $ct_adaptor->fetch_by_name("IMR90");</div>
<div><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">      </span></div><div><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">     </span>my @fsets;</div><div><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">   </span>my $fset_adaptor = $registry->get_adaptor( 'Human', 'funcgen', 'featureset' );</div>
<div><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">      </span>my $fsets_1= $fset_adaptor->fetch_all_by_CellType($ctype_1);</div><div><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">      </span>push @fsets, @{$fsets_1};</div>
<div><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">      </span></div><div> my $ctype_2= $ct_adaptor->fetch_by_name("MRC5");</div><div> #print STDOUT "**". $ctype_2->display_label()."\n"; </div>
<div> my $fsets_2= $fset_adaptor->fetch_all_by_CellType($ctype_2);</div><div> push @fsets, @{$fsets_2};</div><div><br></div>-- <br><font color="#888888"><strong><font face="'courier new', monospace">Maria Xenophontos, BA<br>

MSc Student </font></strong><font face="'courier new', monospace"><br>School of Biological Sciences<br>University of Edinburgh <br>
</font></font><br>
</div>