Hi All<div><br></div><div>I am using SQL sentence to extract variation data with transcritp stable id, such as</div><div><br></div><div><div>SELECT * </div><div>FROM transcript_variation tv</div><div>LEFT JOIN variation_feature vf ON ( vf.variation_feature_id = tv.variation_feature_id ) </div>
<div>WHERE tv.feature_stable_id =  'ENST00000419234'</div></div><div><br></div><div><div>My question is how to distinguish variations types, such as invertion, deletion, indel, substitution and so on.</div><div><br>
</div><div>Thanks </div>-- <br><div><font face="verdana, sans-serif" size="1">Gang Chen</font></div><div><font face="verdana, sans-serif" size="1">TILSI</font></div><div><font face="verdana, sans-serif" size="1"><span style="background-color:rgb(255,255,255)">Taicang Institute For Life Science Information</span><br style="background-color:rgb(255,255,255)">
<span style="background-color:rgb(255,255,255)">Address: A2/162, Renmin South Road, Taicang, 215400, Jiangsu Province, P.R.China</span><br style="background-color:rgb(255,255,255)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)">Phone:£¨+86£©512-82782588</span></font></div>
<br>
</div>