<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=windows-1252"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div>I am testing with the CVS API downloaded today, 2012-09-25.</div><div><br></div><div>I get this error at the line "foreach my $a(split /\//, $new_var->allele_string) {“ in VEP.pm:</div><div><br></div><div>Use of uninitialized value in split at /share/apps/myourshaw/ensembl/ensembl-variation/modules/Bio/EnsEMBL/Variation/Utils/VEP.pm line 4424, <GEN1> line 5029.</div><div><br></div><div>The attached VCF input will cause the error.</div><div><br></div><div>Terminal output also attached so you can see my configuration.</div><div><br></div><div></div></body></html>