Hi Rashid,<div><br></div><div>If you are using API version 66, then the VEP will connect to database version 66.</div><div><br></div><div>You can see this if you use --verbose on the command line; the database version used is also printed in the header of your output file.</div>
<div><br></div><div>Regards</div><div><br></div><div>Will McLaren</div><div>Ensembl Variation</div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On 6 December 2012 10:41, Rashid Mamunur <span dir="ltr"><<a href="mailto:rm8@sanger.ac.uk" target="_blank">rm8@sanger.ac.uk</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Guys,<br>
<br>
Apology for such a naive question .<br>
<br>
I use Variant Effect Predictor [VEP] script to annotate some variants with possible consequences. I use the API version 66.<br>
I was wondering, does the VEP uses the API version as default or just takes the latest data base<br>
version from Ensembl database ??<br>
<br>
thanks,<br>
Mamun<br>
_______________________________________________<br>
Dev mailing list    <a href="mailto:Dev@ensembl.org">Dev@ensembl.org</a><br>
Posting guidelines and subscribe/unsubscribe info: <a href="http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev" target="_blank">http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev</a><br>
Ensembl Blog: <a href="http://www.ensembl.info/" target="_blank">http://www.ensembl.info/</a><br>
</blockquote></div><br></div>