<div dir="ltr">Hi EnsemblGenomes developers<div><br></div><div style>Our Genomes Bacteria local mirror could not start, the error mesage is followed. I have installed samtools and Bio-Samtools , no idea what the solution is. need your help thanks.</div>
<div style><br></div><div style><br></div><div><div>Starting up Ensembl server on host: ensembl-1</div><div>"my" variable $f_aref masks earlier declaration in same scope at /usr/local/ensembl_bacteria/eg-plugins/bacteria/modules/EnsEMBL/Web/ConfigPacker.pm line 368.</div>
<div>"my" variable $f_aref masks earlier declaration in same scope at /usr/local/ensembl_bacteria/eg-plugins/bacteria/modules/EnsEMBL/Web/ConfigPacker.pm line 368.</div><div> Executing perl startup file</div><div>
 Retrieving conf from /usr/local/ensembl_bacteria/conf/config.packed</div><div>unknown database type DATABASE_BACTERIA_ENA</div><div>unknown database type DATABASE_BACTERIA_ENA</div><div>Using a hash as a reference is deprecated at /usr/local/ensembl_bacteria/eg-plugins/bacteria/modules/EnsEMBL/Web/Document/HTML/FTPtable.pm line 55.</div>
<div>Global $r object is not available. Set:</div><div><span class="" style="white-space:pre">      </span>PerlOptions +GlobalRequest</div><div>in httpd.conf at /usr/share/perl/5.10/CGI.pm line 361.</div><div>Compilation failed in require at (eval 769) line 1.</div>
<div><br></div><div> Server information:<br></div><div>......................</div><div>......................</div><div>......................<br></div><div><br></div><div><div>Syntax error on line 37 of /usr/local/ensembl_bacteria/conf/httpd.conf:</div>
<div>Global $r object is not available. Set:\n\tPerlOptions +GlobalRequest\nin httpd.conf at /usr/share/perl/5.10/CGI.pm line 361.\nCompilation failed in require at /usr/local/ensembl_bacteria/conf/perl.startup line 230.\n\t(in cleanup) Global $r object is not available. Set:\n\tPerlOptions +GlobalRequest\nin httpd.conf at /usr/share/perl/5.10/CGI.pm line 361.\nCompilation failed in require at /usr/local/ensembl_bacteria/conf/perl.startup line 230.\nCompilation failed in require at /usr/local/ensembl_bacteria/conf/httpd.conf line 314.\n</div>
</div><div><br></div><div><br></div>-- <br><div><font face="verdana, sans-serif" size="1">Gang Chen</font></div><div><font face="verdana, sans-serif" size="1">TILSI</font></div><div><font face="verdana, sans-serif" size="1"><span style="background-color:rgb(255,255,255)">Taicang Institute For Life Science Information</span><br style="background-color:rgb(255,255,255)">
<span style="background-color:rgb(255,255,255)">Address: A2/162, Renmin South Road, Taicang, 215400, Jiangsu Province, P.R.China</span><br style="background-color:rgb(255,255,255)"><span style="background-color:rgb(255,255,255)">Phone:£¨+86£©512-82782588</span></font></div>

</div></div>