<div dir="ltr">the login info is bogus off at old not longer functioning server so no big deal<div style>thanks will look in to it</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Mon, Apr 15, 2013 at 11:18 AM, Kieron Taylor <span dir="ltr"><<a href="mailto:ktaylor@ebi.ac.uk" target="_blank">ktaylor@ebi.ac.uk</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Gary,<br>
<br>
The IDs you are quizzing Ensembl with are unknown to me. I can only find them in "dictyBase", which we do not refer to. They may be stable IDs of a sort, but not of Ensembl origin, therefore using fetch_by_stable_id will return nothing.<br>

<br>
The code itself looks ok.<br>
<br>
If you have the information readily available, you should try using the gene names instead ( ->fetch_by_display_name ), or find other identifiers that you can feed into our Xref system. ( ->fetch_by_external_name )<br>

<br>
There is a password for you local database in the script you sent to the mailing list. If this is a security concern, you should change it immediately.<br>
<br>
Regards,<br>
<br>
-- <br>
Kieron Taylor PhD.<br>
Ensembl Core team<br>
EBI<div><div class="h5"><br>
<br>
On 15/04/2013 16:43, Gary Duncan wrote:<br>
</div></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div class="h5">
the Perl scrip list all databases but doesn't download the files I<br>
have attached the Perl script and the data file with ids.  Please help<br>
and thanks for your help in this matter.<br>
<br>
<br></div></div>
______________________________<u></u>_________________<br>
Dev mailing list    <a href="mailto:Dev@ensembl.org" target="_blank">Dev@ensembl.org</a><br>
Posting guidelines and subscribe/unsubscribe info: <a href="http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev" target="_blank">http://lists.ensembl.org/<u></u>mailman/listinfo/dev</a><br>
Ensembl Blog: <a href="http://www.ensembl.info/" target="_blank">http://www.ensembl.info/</a><br>
<br>
</blockquote>
<br>
<br>
<br>
<br>
______________________________<u></u>_________________<br>
Dev mailing list    <a href="mailto:Dev@ensembl.org" target="_blank">Dev@ensembl.org</a><br>
Posting guidelines and subscribe/unsubscribe info: <a href="http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev" target="_blank">http://lists.ensembl.org/<u></u>mailman/listinfo/dev</a><br>
Ensembl Blog: <a href="http://www.ensembl.info/" target="_blank">http://www.ensembl.info/</a><br>
</blockquote></div><br></div>