
<html>

  <head>


    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=ISO-8859-1">

  </head>

  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000066">

    Hello,<br>

    <br>

    I'm in need to develop some extra features for VEP.<br>

    <br>

    My input files are in VCF format and also my output.<br>

    <br>

    But I want to add several additional columns for extra data at the

    VCF out.<br>

    <br>

    For example,AA conservation score, Biobase description, Biobase

    link, MAF populations, Flanking sequence, Gene description,

    InterPro_ID and more..<br>

    <br>

    I've been reading the documents and I'm a bit confused about "Custom

    annotations".<br>

    I think since the data I want is extra on the output and not in the

    input, what I should do is develop several Plugins to obtain all the

    values I need.<br>

    <br>

    I think most of them can be obtained through the Ensembl API even if

    I'm new to this. Other will require more hard coding.<br>

    <br>

    I hope someone can clarify me a bit on this matter.<br>

    <br>

    Thank you.<br>

    <br>

    Best regards,<br>

    Guillermo.<br>

  </body>

</html>