
<html>

  <head>


    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=ISO-8859-1">

  </head>

  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000066">

    Hello,<br>

    <br>

    While I'm using VEP flag "--regulatory" flag I notice a weird output

    in my vep file.<br>

    Some lines present all empty columns except: Consequence, Feature

    and Feature_type.<br>

    <br>

    While I'm using VEP plugin Conservation (available in VEP github

    repository) some lines present all empty columns except:

    Consequence, Feature, Feature_type and Conservation.<br>

    <br>

    I would like that the rest of my columns (obtained from VCF through

    plugin) are also show. I think this has something to do with the

    following lines in my plugin:<br>

    <br>

    <pre>sub feature_types {</pre>

    <pre>    return ['Transcript'];</pre>

    <pre>}


</pre>

    I'm am wrong?<br>

    <br>

    Thank you !<br>

    <br>

    Best regards,<br>

    Guillermo.<br>

  </body>

</html>