<html>

  <head>

    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=ISO-8859-1">

  </head>

  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000066">

    Hello,<br>

    <br>

    I've started to recently having problems with VEP script while using

    different plugins (most of them own plugins).<br>

    <br>

    <pre>2013-05-13 13:59:44 - Connected to core version 71 database and variation version 71 database

2013-05-13 13:59:44 - Loaded plugin: vcf_input

2013-05-13 13:59:44 - Loaded plugin: biobase

2013-05-13 13:59:44 - Loaded plugin: aa_grantham_distance

2013-05-13 13:59:44 - Loaded plugin: flanking_sequence

2013-05-13 13:59:44 - Loaded plugin: Condel

2013-05-13 13:59:44 - Output fields redefined (37 defined)

2013-05-13 13:59:44 - Starting...

2013-05-13 13:59:45 - Read 3888 variants into buffer

2013-05-13 13:59:54 - Reading transcript data from cache and/or database

[===============================================]  [ 100% ]

2013-05-13 14:02:38 - Retrieved 6463 transcripts (0 mem, 0 cached, 13743 DB, 7280 duplicates)

2013-05-13 14:02:38 - Calculating consequences

[===================================>           ]   [ 78% ]

ERROR: Forked process failed

</pre>

    I'm not getting any other error message. So I cannot debug properly.

    I thought my plugins were OK but it's seems they don't. I think the

    problem occurs when I use "aa_grantham_distance plugin" together

    with "flanking_sequence". I've no idea what could be causing this.<br>

    <br>

    I'm running VEP on verbose mode but I can't get any usefull

    information. How could I debug that?<br>

    <br>

    Best regards,<br>

    Guillermo.<br>

    <br>

  </body>

</html>