<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
<style>
<!--
@font-face
        {font-family:"Cambria Math"}
@font-face
        {font-family:Calibri}
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri","sans-serif"}
a:link, span.MsoHyperlink
        {color:blue;
        text-decoration:underline}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {color:purple;
        text-decoration:underline}
span.EmailStyle17
        {font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:windowtext}
span.EmailStyle18
        {font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:#1F497D}
.MsoChpDefault
        {font-size:10.0pt}
@page WordSection1
        {margin:72.0pt 72.0pt 72.0pt 72.0pt}
div.WordSection1
        {}
-->
</style>
</head>
<body lang="EN-GB" link="blue" vlink="purple">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">Hello,</p>
<p class="MsoNormal"> </p>
<p class="MsoNormal">I keep receiving the following warning when trying to use the Member adaptor class:</p>
<p class="MsoNormal"> </p>
<p class="MsoNormal"> </p>
<p class="MsoNormal">------------------ DEPRECATED ---------------------</p>
<p class="MsoNormal"> </p>
<p class="MsoNormal">            The Member adaptor is deprecated in favour of the more specific GeneMember and SeqMember adaptors.</p>
<p class="MsoNormal">            Please update your code (change the adaptor) here:</p>
<p class="MsoNormal">        </p>
<p class="MsoNormal">STACK toplevel ./test2.pl:53</p>
<p class="MsoNormal"> </p>
<p class="MsoNormal">You are using the version 71 of the API. The old methods / objects are available for compatibility until version 74 (included)</p>
<p class="MsoNormal">---------------------------------------------------</p>
<p class="MsoNormal"> </p>
<p class="MsoNormal">(line 42) my $member_adaptor = Bio::EnsEMBL::Registry->get_adaptor('Multi', 'compara', 'Member');</p>
<p class="MsoNormal">(line 53) my $member = $member_adaptor->fetch_by_source_stable_id('ENSEMBLGENE','ENSG00000004059');</p>
<p class="MsoNormal"> </p>
<p class="MsoNormal">Is there more specific documentation detailing what the change should be? I tried going through the Ensembl Compara tutorial but it still follows the old API methods.</p>
<p class="MsoNormal"> </p>
<p class="MsoNormal">Best wishes, Samiul</p>
<p class="MsoNormal"> </p>
<p class="MsoNormal"> </p>
<p class="MsoNormal"><b>S<i>amiul Hasan,</i></b></p>
<p class="MsoNormal"><b><i>Senior Scientific Investigator - Computational Biology</i></b><i>,</i></p>
<p class="MsoNormal"><i>Internal 782 8264</i></p>
<p class="MsoNormal"><i>External +44 (0) 1438 76 8264</i></p>
<p class="MsoNormal"><i>STV-2F-137-11, GSK Gunnels Wood Road,</i></p>
<p class="MsoNormal"><i>Stevenage, Hertfordshire</i></p>
<p class="MsoNormal"><i>SG1 2NY, UK</i></p>
<p class="MsoNormal"> </p>
</div>
<br>
<hr>
<font face="Arial" color="Gray" size="1"><br>
This e-mail was sent by GlaxoSmithKline Services Unlimited<br>
(registered in England and Wales No. 1047315), which is a<br>
member of the GlaxoSmithKline group of companies. The<br>
registered address of GlaxoSmithKline Services Unlimited<br>
is 980 Great West Road, Brentford, Middlesex TW8 9GS.<br>
</font>
</body>
</html>