<div dir="ltr">I think I'll try it with CGI escape and unescape, since as a rule I try and avoid using any non-core Perl modules in the VEP in order to make it easier to install.<div><br></div><div>Cheers</div><div><br>
</div><div>Will</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On 22 July 2013 21:27, Reece Hart <span dir="ltr"><<a href="mailto:reece@harts.net" target="_blank">reece@harts.net</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="im">On Mon, Jul 22, 2013 at 1:26 AM, Will McLaren <span dir="ltr"><<a href="mailto:wm2@ebi.ac.uk" target="_blank">wm2@ebi.ac.uk</a>></span> wrote:<br>
<div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

<div>I'm not sure what would be best to do here - I could pick a character to swap it to, or perhaps something like "eq" instead?</div><div><br></div><div>Do any other VEP users have a preference?</div>
<div></div></blockquote></div><br></div>I think a standard encoding mechanism is preferable to an ensembl-specific one. How about url encoding (e.g., %3D)? I think URI::Escape should do it. Probably also worth noting in the VCF header that CSQ is URI-escaped.</div>


<div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">Thanks Will!</div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">-Reece</div><div class="gmail_extra"><br>
</div></font></span></div>
<br>_______________________________________________<br>
Dev mailing list    <a href="mailto:Dev@ensembl.org">Dev@ensembl.org</a><br>
Posting guidelines and subscribe/unsubscribe info: <a href="http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev" target="_blank">http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev</a><br>
Ensembl Blog: <a href="http://www.ensembl.info/" target="_blank">http://www.ensembl.info/</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>