<div dir="ltr">Whoops - sorry to bother - thought I tried that. Thanks! </div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jul 24, 2013 at 4:49 AM, Andy Yates <span dir="ltr"><<a href="mailto:ayates@ebi.ac.uk" target="_blank">ayates@ebi.ac.uk</a>></span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Brett,<br>
<br>
Why of course. The feature endpoint can query for a region by a stable ID and you can request the feature type CDS e.g.<br>
<br>
<a href="http://beta.rest.ensembl.org/feature/id/ENST00000544455.gff3?feature=cds" target="_blank">http://beta.rest.ensembl.org/feature/id/ENST00000544455.gff3?feature=cds</a><br>
<br>
It's not perfect but it will give you the coding boundaries of a transcript.<br>
<br>
Andy<br>
<br>
Andrew Yates                   Ensembl Core Software Project Leader<br>
EMBL-EBI                       Tel: +44-(0)1223-492538<br>
Wellcome Trust Genome Campus   Fax: +44-(0)1223-494468<br>
Cambridge CB10 1SD, UK         <a href="http://www.ensembl.org/" target="_blank">http://www.ensembl.org/</a><br>
<div><div class="h5"><br>
On 23 Jul 2013, at 22:11, Brett Thomas <<a href="mailto:bthomas@atgu.mgh.harvard.edu">bthomas@atgu.mgh.harvard.edu</a>> wrote:<br>
<br>
> Hi dev -- quick question here. Is there a way to get a list of coding regions for a gene from the rest API? I've been using it to collect the set of exon boundaries for a gene, but I want to restrict it to only coding regions<br>


><br>
> Thanks!<br>
> Brett<br>
</div></div>> _______________________________________________<br>
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> Ensembl Blog: <a href="http://www.ensembl.info/" target="_blank">http://www.ensembl.info/</a><br>
<br>
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<br>
</blockquote></div><br></div>