<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:arial,sans-serif;font-size:12.727272033691406px">Hi Matthieu,</span><div style="color:rgb(0,0,0);font-family:arial,sans-serif;font-size:12.727272033691406px">
Many thanks for the quick answer.  I looked at some cases where this happens and the genes in question don't align particularly well but there are also others which are similarly distant and have more reasonable branch lengths.  I guess for now I'll just exclude the troublesome genes from my analyses.</div>
<div style="color:rgb(0,0,0);font-family:arial,sans-serif;font-size:12.727272033691406px"><br></div><div style="color:rgb(0,0,0);font-family:arial,sans-serif;font-size:12.727272033691406px">Best,<br>Greg</div></div><br clear="all">
<div><br></div>-- <br><div dir="ltr">Greg Slodkowicz<br>PhD student, Nick Goldman group<br>European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI)<br></div></div>