<div dir="ltr"><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.800000190734863px">Dear All,</span><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.800000190734863px">It has been a while since I spammed this mailing list ;)</div>
<div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.800000190734863px"><br></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.800000190734863px">Since BioMart remains a major interface to Ensembl data, I thought you may be interested in new developments there.</div>
<span class="" style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.800000190734863px"><font color="#888888"><div><br></div><div>a</div></font></span><br><div class="gmail_quote">---------- Forwarded message ----------<br>From: <b class="gmail_sendername">Arek Kasprzyk</b> <span dir="ltr"><<a href="mailto:arek.kasprzyk@gmail.com">arek.kasprzyk@gmail.com</a>></span><br>
Date: 20 May 2014 16:22<br>Subject: BioMart 0.9 released<br>To: <a href="mailto:biomart-announce@googlegroups.com">biomart-announce@googlegroups.com</a><br><br><br><div dir="ltr"><p class="MsoNormal" style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.800000190734863px">
<span style="font-family:Arial"><br></span></p><p class="MsoNormal" style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.800000190734863px">
<span style="font-family:Arial">We are pleased to announce the release of BioMart version 0.9.</span><span style="font-family:Times"></span></p><p class="MsoNormal" style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.800000190734863px">

<span style="font-family:Arial"> </span></p><p class="MsoNormal" style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.800000190734863px;text-align:justify"><span lang="EN-GB" style="font-family:Arial">The latest version of BioMart includes support for data analysis and visualisation tools. The first of the BioMart tools has already been implemented and is accessible from <a href="http://www.biomart.org/" target="_blank">www.biomart.org</a>. This tool enables enrichment analysis of genes in all Ensembl species and a broad range of gene identifiers for each species are also available. Furthermore, the tool supports cross-species analysis using Ensembl homology data. Finally, the enrichment tool facilitates analysis of BED files containing genomic features such as Copy Number Variations (CNVs) or Differentially Methylated Regions (DMRs).</span></p>

<p class="MsoNormal" style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.800000190734863px;text-align:justify"><span lang="EN-GB" style="font-family:Arial"> </span></p><p class="MsoNormal" style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.800000190734863px;text-align:justify">

<span style="font-family:Arial">The latest BioMart release comes with the new version of the REST and SOAP APIs. These APIs are available for testing at <u><span style="color:rgb(17,85,204)"><a href="http://central.biomart.org/" target="_blank">central.biomart.org</a></span></u>. Third party developers who are currently using REST or SOAP version 0.7 are encouraged to start testing and transitioning to 0.9. The two servers providing access to BioMart data through REST and SOAP (version 0.7 and version 0.9) will be running in parallel to provide support for easy transition. </span><span lang="EN-GB" style="font-family:Arial">The Enrichment tool is also accessible programmatically through 0.9 REST/SOAP interface.</span></p>

<p class="MsoNormal" style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.800000190734863px;text-align:justify"><span style="font-family:Arial"> </span></p><p class="MsoNormal" style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.800000190734863px;text-align:justify">

<span style="font-family:Arial">Finally, the BioMart website has been completely redesigned to cater for a better user experience. The re-organised layout, incorporation of new functionality, such as the "quick tool access" and the use of subtle animation makes for clearer navigation and greater site interactivity.</span></p>

<p class="MsoNormal" style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.800000190734863px;text-align:justify"><span style="font-family:Arial;color:rgb(80,0,80)"> </span></p><p class="MsoNormal" style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.800000190734863px;text-align:justify">

<span style="font-family:Arial;color:rgb(80,0,80)">Your feedback is welcome and appreciated.</span></p><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.800000190734863px"><br></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.800000190734863px">

<br></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.800000190734863px"><br></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:12.800000190734863px"><div>On behalf of the BioMart developers </div><div>
<div><br></div><div>Arek<img src="https://mail.google.com/mail/ca/u/0/images/cleardot.gif"></div></div><span class=""><font color="#888888"><br></font></span></div><span class=""><font color="#888888"><div><br></div>-- <br>
<div dir="ltr">
<h1 style="margin:0px 0px 15px;font-weight:normal;padding:0px;font-size:14px;font-family:georgia,serif"><div style="font-family:arial;font-size:small"><div style="color:rgb(34,34,34);line-height:normal"><span style="font-size:12.800000190734863px;color:rgb(24,24,24);font-family:georgia,serif;line-height:18px"><div>

<p dir="ltr" style="color:rgb(34,34,34);font-size:12.800000190734863px;line-height:normal;font-family:arial,sans-serif">Arek Kasprzyk, MD. MSc. Ph.D.</p><p dir="ltr" style="color:rgb(34,34,34);font-size:12.800000190734863px;line-height:normal;font-family:arial,sans-serif">

Head of Data Management<br>Center for Translational Genomics and Bioinformatics<br>San Raffaele Scientific Institute<br>Via Olgettina 58<br>20132 Milano<br>Italy</p></div></span></div></div></h1><h1 style="margin:0px 0px 15px;color:rgb(24,24,24);font-weight:normal;padding:0px;font-size:14px;font-family:georgia,serif;line-height:18px">

<div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial;font-size:small;line-height:normal"><div style="font-size:12.800000190734863px;font-family:arial,sans-serif"></div></div></h1><div></div></div>
</font></span></div>
</div><div><br></div><div dir="ltr"><h1 style="margin:0px 0px 15px;color:rgb(24,24,24);font-weight:normal;padding:0px;font-size:14px;font-family:georgia,serif;line-height:18px"><div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial;font-size:small;line-height:normal">
<div style="font-size:12.800000190734863px;font-family:arial,sans-serif"></div></div></h1><div></div></div>
</div>