<div dir="ltr">Hi,<div><br></div><div>When adding cusom annotations in VEP using a bed file as described here:</div><div><br></div><div><a href="http://www.ensembl.org/info/docs/tools/vep/script/vep_custom.html">http://www.ensembl.org/info/docs/tools/vep/script/vep_custom.html</a></div>
<div><br clear="all"><div>does the annotation type 'overlap' cause the reporting of all overlapping regions in the BED file for a given input variant? How is the overlap assessed for imbalanced variants?</div><div>
<br></div><div>Thanks,</div><div><br></div>-- <br><div dir="ltr">G.</div>
</div></div>