<div dir="ltr"><div>Hi,</div><div><br></div><div>I have a question about converting VCF to BED format for unbalanced variants:</div><div><br></div><a href="http://www.ensembl.org/info/docs/tools/vep/vep_formats.html">http://www.ensembl.org/info/docs/tools/vep/vep_formats.html</a><br clear="all">
<div><br></div><div>Is there a consensus as to how the start and end positions should be calculated in the BED format?</div><div><br></div><div>For instance dbSNP provides files in bed format but found no information about that.</div>
<div><br></div><div>Regards,</div><div><br></div>-- <br><div dir="ltr">G.</div>
</div>