<div dir="ltr">Hi Konrad,<div><br></div><div>Thanks for the suggestions; both good ideas, but I think they will have to wait for the next VEP release.</div><div><br></div><div>Fortunately this will coincide with the first Ensembl release on GRCh38!</div>
<div><br></div><div>Regards</div><div><br></div><div>Will McLaren</div><div>Ensembl Variation</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On 28 May 2014 22:37, Konrad Karczewski <span dir="ltr"><<a href="mailto:konradk@broadinstitute.org" target="_blank">konradk@broadinstitute.org</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div style="word-wrap:break-word">Hi everyone,<div><br></div><div>I noticed we can use get_header_info to write into the VEP header, but when this writes to VCF, it simply puts the key into the pipe-delimited list. Is there any way a plugin can put more info into the VCF header? Particularly, I was wondering if it'd be possible to write a separate line with plugin (and VEP) version info.</div>
<div><br></div><div>Actually, regardless and slightly related, VEP version info (and command-line parameters) would be a useful thing to write into the VCF, a la Picard/GATK. Would help in reproducibility (especially as GRCh38 comes along).<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
<div>
<div style="color:rgb(0,0,0);letter-spacing:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;word-wrap:break-word"><div style="color:rgb(0,0,0);font-family:Helvetica;font-size:12px;font-style:normal;font-variant:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px">
<br>-Konrad</div></div>
</div>

<br></font></span></div></div><br>_______________________________________________<br>
Dev mailing list    <a href="mailto:Dev@ensembl.org">Dev@ensembl.org</a><br>
Posting guidelines and subscribe/unsubscribe info: <a href="http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev" target="_blank">http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev</a><br>
Ensembl Blog: <a href="http://www.ensembl.info/" target="_blank">http://www.ensembl.info/</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>