<div dir="ltr">Hi Cyriac,<div><br></div><div>Thanks for spotting this, I've patched in a fix to the ensembl-variation API module for this; you can retrieve it by rerunning the INSTALL.pl script, or by updating your API checkout from GitHub.</div>
<div><br></div><div>The web code will also be updated shortly.</div><div><br></div><div>Regards</div><div><br></div><div>Will McLaren</div><div>Ensembl Variation</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">
On 29 August 2014 00:24, Cyriac Kandoth <span dir="ltr"><<a href="mailto:kandoth@cbio.mskcc.org" target="_blank">kandoth@cbio.mskcc.org</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr"><div>Hello,</div><div><br></div><div>I discovered this using the standalone VEP script in offline mode, but was able to reproduce it in the online web-service as follows:</div><div><a href="http://grch37.ensembl.org/Homo_sapiens/Tools/VEP" target="_blank">http://grch37.ensembl.org/Homo_sapiens/Tools/VEP</a></div>

<div><br></div><div>Input: chr7  140453136  140453136  A/T  +</div><div>Select: 1000 Genomes continental allele frequencies</div><div><br></div><div>Hit run, and in the output, AFR_MAF is reported as 21499247 which cannot be a minor allele frequency.</div>

<div><br></div><div>Thanks,</div><div>Cyriac</div></div>
<br>_______________________________________________<br>
Dev mailing list    <a href="mailto:Dev@ensembl.org">Dev@ensembl.org</a><br>
Posting guidelines and subscribe/unsubscribe info: <a href="http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev" target="_blank">http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev</a><br>
Ensembl Blog: <a href="http://www.ensembl.info/" target="_blank">http://www.ensembl.info/</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>