Great, thanks a lot! /Greg<br><br><div class="gmail_quote">On Wed Jan 14 2015 at 4:35:40 PM mag <<a href="mailto:mr6@ebi.ac.uk">mr6@ebi.ac.uk</a>> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
  
    
  
  <div bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    Hi Greg,<br>
    <br>
    The list of all three-letter species code can be found here:<br>
    <a href="http://www.ensembl.org/info/genome/stable_ids/index.html" target="_blank">http://www.ensembl.org/info/genome/stable_ids/index.html</a><br>
    <br>
    This information is also stored in the database for each species,
    for the meta_key species.stable_id_prefix<br>
    <br>
    <br>
    Hope that helps,<br>
    Magali</div><div bgcolor="#FFFFFF" text="#000000"><br>
    <br>
    <div>On 14/01/2015 15:54, Greg Slodkowicz
      wrote:<br>
    </div>
    </div><div bgcolor="#FFFFFF" text="#000000"><blockquote type="cite">Hi all,<br>
      I was wondering what's the best way to get a comprehensive list of
      the three-letter species codes, as they appear in various
      identifiers, such as 'ENSMUSG...' etc., ideally also with a
      mapping to numerical taxids?<br>
      <br>
      I found the list at <a href="http://www.ensembl.org/info/about/species.html" target="_blank">http://www.ensembl.org/info/about/species.html</a>
      and I can see that there is an option to export the table to CSV
      but the three letter codes are not there.<br>
      <br>
      <br>
      Best,<br>
      Greg<br>
      <br>
      <fieldset></fieldset>
      <br>
      </blockquote></div><div bgcolor="#FFFFFF" text="#000000"><blockquote type="cite"><pre>_______________________________________________
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