
<html>

  <head>


    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=utf-8">

  </head>

  <body text="#000066" bgcolor="#FFFFFF">

    Dear devs,<br>

    <br>

    If --hgvs option is enabled when running VEP is it possible to

    retrieve HGVS for each transcript?<br>

    I've been looking the documentation Will referenced me in previous

    post,<br>

    <br>

    At first I thought I could retrieve it from "mapper" <br>

    my $mapper =

    $vf->transcript->{_variation_effect_feature_cache}->{mapper};<br>

    <br>

    however I've inspected the hash and I couldn't find it.<br>

    <br>

    Regards,<br>

    Guillermo.<br>

  </body>

</html>