<div dir="ltr"><span style="font-size:13px">Hello,</span><div style="font-size:13px"><br></div><div style="font-size:13px">I've been searching for a schema that delineates key relationships between the top-level databases at Ensembl such as Core, FuncGen, etc. Unfortunately, I have been unable to find a schema graphic, png or otherwise. </div><div style="font-size:13px"><br></div><div style="font-size:13px">(I understand some Core tables are reflected in FuncGen. I furthermore understand I can do these queries using Biomart, but I was hoping to have/use standard MySQL queries as well).</div><div style="font-size:13px"><br></div><div style="font-size:13px">For example, I can't find documentation on the Foreign key relationships between:<br></div><div style="font-size:13px"><br>rattus_norvegicus_funcgen_78_5.xref.dbprimary_acc   <-->  rattus_norvegicus_core_78_5</div><div style="font-size:13px"><br><br></div><div style="font-size:13px">My guess for a key relationship in 'core'  is:  rattus_norvegicus_core_78_5.transcript.stable_id<br></div><div style="font-size:13px"><br></div><div style="font-size:13px"><br></div><div style="font-size:13px">Thus to connect the two top-level databases this leads to a rather odd-looking WHERE clause:</div><div style="font-size:13px"><br></div><div style="font-size:13px">"WHERE rattus_norvegicus_funcgen_78_5.xref.dbprimary_acc = rattus_norvegicus_core_78_5.transcript.stable_id"</div><div style="font-size:13px"><br></div><div style="font-size:13px"><br>Maybe this is incredibly obvious, but sometimes *incredibly* obvious things sometimes turn out to be *incredibly* wrong.  So I thought I'd check with Ensembl.<br><br>Any help appreciated,<br><br>Thanks, <br><br>Bill<br><br>William Michels, Ph.D.<br>Assistant Research Biochemist, UCSF (former)</div></div>