<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=Windows-1252">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
<div style="">
<div>
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
<div>I’m having some trouble getting the VEP to work on a P.berghei cache downloaded from ensemblgenomes (<a href="ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub/protists/current/vep/">ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub/protists/current/vep/</a>). Though it doesn’t seem to
 be throwing any errors and is apparently reading in the correct files for each chromosome, I’m still not getting any transcripts found for any loci. </div>
<div><br>
</div>
<div>Could be a version issue, but is there any way to be sure of the ensembl version from the cache itself? or is there somewhere else I should be looking?</div>
<div><br>
</div>
<div>thanks</div>
<div><br>
</div>
<div>-s</div>
<div><br>
</div>
<br>
<div apple-content-edited="true">
<div style="letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
<div>--</div>
<div apple-content-edited="true">
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
<div>Seth Redmond</div>
<div>Senior Bioinformatician<br>
Parasite Genomics<br>
  Wellcome Trust Sanger Institute<br>
  Genome Campus</div>
<div>  Hinxton CB10 1SA</div>
<div><a href="mailto:snr@sanger.ac.uk">snr@sanger.ac.uk</a></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<br>
</div>
</div>
</div>
<br>
</body>
</html>