<div dir="ltr">Hi Ensembl team,<div><br></div><div>I am currently doing a comparative analysis of some ChIP-seq datasets between mouse, chicken and turtle (P. sinensis). Therefore, I was interested in getting a cross-species coordinate conversion, like assembly converter or liftover. I've seen that you have these two pairwise alignments done:</div><div><br></div><div><div>Mouse-Chicken pairwise alignment</div><div><a href="http://www.ensembl.org/info/genome/compara/mlss.html?mlss=633">http://www.ensembl.org/info/genome/compara/mlss.html?mlss=633</a></div><div><br></div><div>Chicken-Turtle pairwise alignment</div><div><a href="http://www.ensembl.org/info/genome/compara/mlss.html?mlss=657">http://www.ensembl.org/info/genome/compara/mlss.html?mlss=657</a></div><div><br></div><div>So, I was wondering if I could get the best subset of chains from your LASTZ-net results (i.e., the liftover chain files) so that I can do myself a liftOver. I have not seen this files for download in the Ensembl webpage, so could you let me know how to get them?</div><div><br></div><div>Thank you very much,</div><div>Juan</div><div><br></div>
</div></div>