<div dir="ltr"><div>Dear Developers</div><div><br></div><div>Please consider the transcript :</div><div><br></div><div>ENST00000470357</div><div><br></div><div>I am trying to retrieve the coordinates of UTR regions of this transcript</div><div>To this end I have a script that basicaly starts with the transcript feature object $transcript</div><div><br></div><div>my $five_prime  = $transcript->five_prime_utr_Feature;</div><div><br></div><div>$feature_params->{start} = $five_prime->start;</div><div>$feature_params->{end}  = $five_prime->end;</div><div><br></div><div>However, in this case the script will output the coordinates from the start of the 1st non_coding exon to the end of the non-coding portion of the 3rd exon (chr1<span class="" style="white-space:pre">        </span>7772707<span class="" style="white-space:pre">   </span>7777171).</div><div>How can I change this so that the script will only output the coordinates of the non-coding exon portions?</div><div><br></div><div>In this case I would like to output:</div><div><br></div><div>chr1<span class="" style="white-space:pre">        </span>7772707<span class="" style="white-space:pre">   </span>7773198</div><div>chr1<span class="" style="white-space:pre">        </span>7773442<span class="" style="white-space:pre">   </span>7773511</div><div>chr1<span class="" style="white-space:pre">        </span>7777160<span class="" style="white-space:pre">   </span>7777171</div><div><br></div><div>This there a simple way of achieving this?</div><div><br></div><div>Many thanks</div><div><br></div><div>Duarte</div><div><br></div><div>
</div></div>