<div dir="ltr">Hello,<div><br></div><div>"%3D" is the URL-encoded version of the "=" character, so the unencoded version reads <span style="font-size:12.8000001907349px">NM_015658.3:c.1843C>T(p.=). The "p.="  means that the protein sequence is unchanged.</span><div><br></div><div>We encode it this way since the "=" character is used elsewhere in the VEP output as a delimiter, so its appearance in HGVSp strings would break downstream parsers.</div><div><br></div><div>You can force VEP to print out "=" instead of "%3D" using --no_escape, though of course you must then be careful parsing the results file!</div><div><br></div><div>Regards</div><div><br></div><div>Will McLaren</div><div>Ensembl Variation</div></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On 27 April 2015 at 08:48, namchul ghim <span dir="ltr"><<a href="mailto:chulghim@gmail.com" target="_blank">chulghim@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div>synonymous_variant         NM_015658.3:c.1843C>T(p.%3D)    <br></div></div><div><br></div><div>What does  the (p.%3D) means?<br></div><div><br></div><div>Anybody help me !!!<br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div></div>
<br>_______________________________________________<br>
Dev mailing list    <a href="mailto:Dev@ensembl.org">Dev@ensembl.org</a><br>
Posting guidelines and subscribe/unsubscribe info: <a href="http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev" target="_blank">http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev</a><br>
Ensembl Blog: <a href="http://www.ensembl.info/" target="_blank">http://www.ensembl.info/</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>