<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=us-ascii"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">Hi Will, everyone,<div class=""><br class=""></div><div class="">Are RegulatoryFeature annotations expected to have the same results in VEP v79 (GRCh37) as previous versions (e.g. v77)? When annotating the ExAC VCF, the older versions included many ENSR* annotations, but v79's do not (same command including --everything both times). For instance, the following variant used to overlap ENSR00000528767 but does not seem to in my most recent version:</div><div class=""><br class=""></div><div class="">1       13372   .       G       C</div><div class=""><br class=""></div><div class="">Any idea why this might be happening? All other annotations seem fine.<br class=""><div class=""><br class="webkit-block-placeholder"></div><div apple-content-edited="true" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class=""><div style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">Thanks!<br class="Apple-interchange-newline">-Konrad</div></div>
</div>

<br class=""></div></body></html>