<div dir="ltr"><div><div>Hi!<br><br></div>I have a list of Ensembl protein IDs and I want to know wich protein are they referring to, specifically I want to know the difference between different proteins derived  from the same gene. Is there an annotated description linked to these Ensembl protein ID which can give me this information? Or should I retrieve the protein sequence and blast them against each other to see in what they differ? If the difference is small and I don't find a domain associated to them how can I know that the affected aa are not relevant for the function of the protein (phosphorilated residues or key aa for the proper folding of the protein)?<br><br></div><div>I searched a bit in internet but I couldn't find a straightforward way to do it (if I query biomart I have the same description for the gene, didn't I select the right attributes?)<br><br></div><div>Also I used perl ENSEMBL API to find the domain IDs associated to some exons of interest. Is there any database in which I can search the meaning of these protein IDs? they are from different databases (PFAM, Interpro, etc), should I look to each database separately?<br><br></div><div>Thanks!<br></div><div><br></div></div>