<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body>
<div><br>
</div>
<div>Duarte,</div>
<div>What version of Ubuntu?  14.04 is typically a big problem with older LAMP architecture install instructions.</div>
<div>Ed</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div id="composer_signature">
<div style="font-size:10px">Sent from my Smartphone</div>
</div>
<br>
<br>
-------- Original message --------<br>
From: Duarte Molha <duartemolha@gmail.com> <br>
Date: 06/29/2015 5:56 AM (GMT-05:00) <br>
To: Ensembl <dev@ensembl.org> <br>
Subject: [ensembl-dev] Installing ensembl site <br>
<br>
<div>
<div dir="ltr">Dear Ensembl Devs
<div><br>
</div>
<div>Your manual to how to install a local version of your ensembl site are woefully incomplete and out ot date.</div>
<div><br>
</div>
<div>Is there any willingness of fixing these instructions?</div>
<div><br>
</div>
<div>A few of my remarks:</div>
<div><br>
</div>
<div><a href="http://www.ensembl.org/info/docs/webcode/mirror/install/non-ensembl-code.html">http://www.ensembl.org/info/docs/webcode/mirror/install/non-ensembl-code.html</a><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>The description on how to build configure and install and configure Apache server and mod_perl are incomplete and even my attempts at following the steps on my debian server simply fail due to missing dependencies.</div>
<div><br>
</div>
<div>Given most people will be running servers on debian and ubuntu and similar servers it would be very welcome a more targeted approach to the usual default configuration of systems after after a simple</div>
<div>
<div><br>
</div>
<div>sudo apt-get install git</div>
</div>
<div>sudo apt-get install apache2<br>
</div>
<div>
<div>sudo apt-get install libapache2-mod-perl2<br>
</div>
</div>
<div><br>
</div>
<div>?</div>
<div><br>
</div>
<div>This is the way I have opted to install git,  apache and mod_perl and I think because if it, I still have not been able to setup the site properly because your setup assumes wrong folder locations for many of the apache2  configuration files installed
 in this manner.</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div><a href="http://www.ensembl.org/info/docs/webcode/mirror/install/ensembl-code.html">http://www.ensembl.org/info/docs/webcode/mirror/install/ensembl-code.html</a><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>
<pre class="" style="font-family:'Courier New',Courier,monospace; font-size:12px; margin-top:0px; margin-bottom:16px; border:1px solid rgb(204,204,204); overflow:auto; line-height:16px; color:rgb(85,85,85); padding:8px!important; background:rgb(240,240,240)">git ensembl --clone api
git ensembl --clone web</pre>
</div>
<div>The instructions above are incorrect</div>
<div><br>
</div>
<div>I think they should be :</div>
<div><br>
</div>
<div>
<pre class="" style="font-family:'Courier New',Courier,monospace; font-size:12px; margin-top:0px; margin-bottom:16px; border:1px solid rgb(204,204,204); overflow:auto; line-height:16px; color:rgb(85,85,85); padding:8px!important; background:rgb(240,240,240)">git-ensembl --clone api
git-ensembl --clone web</pre>
</div>
<div>correct me if I am wrong, please.</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div><a href="http://www.ensembl.org/info/docs/webcode/mirror/running.html">http://www.ensembl.org/info/docs/webcode/mirror/running.html</a><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>As indicated before, these instructions assume a non-standard apache setup.</div>
<div>At least in debian and ubuntu ... there is no httpd command</div>
<div><br>
</div>
<div>apache2 server is started using the command :</div>
<div><br>
</div>
<div>
<div>sudo apache2ctl start</div>
</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>I hope this has highlighted a few of the difficulties with your documentation</div>
<div>Maybe these are problems only to newbies like me... but at least, maybe they can help other that are also experiencing difficulties following your manual.</div>
<div><br>
</div>
<div>Best regards</div>
<div><br>
</div>
<div>Duarte</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div><br clear="all">
<div>
<div class="x_gmail_signature"><font color="#999999" style="background-color:rgb(255,255,255)">=========================<br>
     Duarte Miguel Paulo Molha      <br>
</font>
<div><font color="#999999" style="background-color:rgb(255,255,255)">         <a href="http://about.me/duarte" target="_blank">http://about.me/duarte</a>         <br>
=========================</font></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>