<div dir="ltr">Hi Luke,<div><br></div><div>It just so happens I kept a copy of our last 36 build around for a request like this :-)</div><div><br></div><div>You can download the cache file from here: <a href="https://dl.dropboxusercontent.com/u/12936195/homo_sapiens_vep_54_NCBI36.tar.gz">https://dl.dropboxusercontent.com/u/12936195/homo_sapiens_vep_54_NCBI36.tar.gz</a></div><div><br></div><div>After unpacking it in "$HOME/.vep", you will need to run VEP in offline mode (--offline) and specify "--cache_version 54" to use it.</div><div><br></div><div>You will almost certainly find that a lot of options don't work or cause VEP to crash, so use at your own risk, but it seems to work OK for basic consequence types, which I assume is your use case.</div><div><br></div><div><div>$ echo "1 228912417 . A G" | perl <a href="http://variant_effect_predictor.pl">variant_effect_predictor.pl</a> -cache_version 54 -offline -o stdout -no_stats | grep -v #</div><div>1_228912417_A/G 1:228912417     G       ENSG00000135744 ENST00000366667 Transcript      missense_variant        916     803     268     M/T      aTg/aCg -       IMPACT=MODERATE;STRAND=-1</div></div><div><br></div><div>Regards</div><div><br></div><div>Will McLaren</div><div>Ensembl Variation</div><div><br></div><div><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On 8 August 2015 at 13:59,  <span dir="ltr"><<a href="mailto:luke@well.ox.ac.uk" target="_blank">luke@well.ox.ac.uk</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Dear Ensembl devs,<br>
<br>
I have a request about the VEP files available online.<br>
<br>
In attempting to analyse a large number of older .maf files with VEP, I<br>
couldn’t find a public cache for hg18 (build 36). Would it be at all<br>
possible to add this to the available genome caches? I would be incredibly<br>
grateful, as this would be a much neater fix than lifting over the<br>
coordinates (and losing information in the process).<br>
<br>
Many thanks,<br>
Yours faithfully,<br>
<br>
Luke Freeman-Mills<br>
<br>
PhD Student, MPG lab<br>
Oxford<br>
<br>
<br>
<br>
_______________________________________________<br>
Dev mailing list    <a href="mailto:Dev@ensembl.org">Dev@ensembl.org</a><br>
Posting guidelines and subscribe/unsubscribe info: <a href="http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev</a><br>
Ensembl Blog: <a href="http://www.ensembl.info/" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.ensembl.info/</a><br>
</blockquote></div><br></div>