<div dir="ltr">Correct, yes, you can assume they are the same unless there are a "-" separated pair of coords.<div><br></div><div>Will</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On 8 September 2015 at 13:35, Guillermo Marco Puche <span dir="ltr"><<a href="mailto:guillermo.marco@sistemasgenomicos.com" target="_blank">guillermo.marco@sistemasgenomicos.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
  
    
  
  <div bgcolor="#FFFFFF" text="#000066">
    Ok I'm sorry I just found a record where I obtain start-end
    position. Forget the question.<br>
    I can assume that start/end position is the same if only one
    coordinate is found in field.<br>
    <br>
    Regards,<br>
    Guillermo.<div><div class="h5"><br>
    <br>
    <div>On 08/09/15 14:30, Guillermo Marco
      Puche wrote:<br>
    </div>
    </div></div><blockquote type="cite"><div><div class="h5">
      
      Hello,<br>
      <br>
      Is it possible to retrieve <b>cds_start</b> and <b>cds_end</b>
      positions from CDS_position field in VEP when using VCF as output
      format?<br>
      I would like to get start/end also for cdna and protein.<br>
      <br>
      In VCF output I see a unique coordiante in those fields (<b>CDS_position,

        Protein_position and cDNA_position</b>) however in <a href="http://www.ensembl.org/info/docs/tools/vep/vep_formats.html#output" target="_blank"></a><a href="http://www.ensembl.org/info/docs/tools/vep/vep_formats.html#output" target="_blank">http://www.ensembl.org/info/docs/tools/vep/vep_formats.html#output</a>
      I can see start/end (at least for JSON output).<br>
      <br>
      Thank you!<br>
      <br>
      Regards,<br>
      Guillermo.<br>
      <br>
      <fieldset></fieldset>
      <br>
      </div></div><pre>_______________________________________________
Dev mailing list    <a href="mailto:Dev@ensembl.org" target="_blank">Dev@ensembl.org</a>
Posting guidelines and subscribe/unsubscribe info: <a href="http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev" target="_blank">http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev</a>
Ensembl Blog: <a href="http://www.ensembl.info/" target="_blank">http://www.ensembl.info/</a>
</pre>
    </blockquote>
  </div>

<br>_______________________________________________<br>
Dev mailing list    <a href="mailto:Dev@ensembl.org">Dev@ensembl.org</a><br>
Posting guidelines and subscribe/unsubscribe info: <a href="http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev</a><br>
Ensembl Blog: <a href="http://www.ensembl.info/" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.ensembl.info/</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>