<div dir="ltr">Hi Gaurav,<div><br></div><div>All SNPs that are polymorphic (i.e. have all alleles observed) amongst the relevant population(s) are used.</div><div><br></div><div>Regards</div><div><br></div><div>Will McLaren</div><div>Ensembl Variation</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On 17 November 2015 at 11:33, Gaurav Thareja <span dir="ltr"><<a href="mailto:gaurav4thareja@gmail.com" target="_blank">gaurav4thareja@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Hi all,<br><br></div>The population LD plots generated use tag SNPs or all the SNPs in the region?<br><div><br><div>Regards<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br><div><br>Gaurav Thareja</div>
</font></span></div></div></div>
<br>_______________________________________________<br>
Dev mailing list    <a href="mailto:Dev@ensembl.org">Dev@ensembl.org</a><br>
Posting guidelines and subscribe/unsubscribe info: <a href="http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.ensembl.org/mailman/listinfo/dev</a><br>
Ensembl Blog: <a href="http://www.ensembl.info/" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.ensembl.info/</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>