<div dir="ltr"><div><div>Dear Konrad,<br><br></div><div>I have some variant-transcript pairs and the LOFTEE annotations I got by running it locally and checking ExAc website are different: ExAc reported "high-confidence" while I got "LC".  It seems to me that all of these variants are related to splicing and I listed three examples below.  Could you please kindly take a look?  Hope I didn't miss anything obvious.  I was running VEPv83 and downloaded LOFTEE on March 9th.<br></div><div><br></div><div>Thank you for you help.<br><br></div><div>Best,<br></div><div>Wei<br></div><div><br>1:2451336129_A/G, ENST00000366523<br></div>5:177474136_T/C, ENST00000511189<br></div>8:130789839_T/C, <a href="http://exac.broadinstitute.org/transcript/ENST00000276708">
                    ENST00000276708</a><br><br><br></div>